O curso de Engenharia Química foi concebido em 2009, através da Resolução 005-CONSU/UEAP, de 10 de agosto do mesmo ano, para formar profissionais qualificados e capacitados para difundir conhecimentos e propor soluções viáveis para contornar a problemática regional, envolvendo os recursos biotecnológicos (alimentos e produtos naturais), materiais e resíduos, tendo, portanto, um apelo ambiental. Com a criação do curso de Engenharia Química no Estado do Amapá ficou concretizado o terceiro curso na Região Norte não havendo assim a necessidade dos filhos do Amapá se deslocarem para outros Estados da Federação a fim de obterem tal formação técnica superior. Para tanto, a Universidade do Estado do Amapá – UEAP já contava com vários laboratórios, principalmente os de Química (Geral, Inorgânica, Analítica, Orgânica, Bioquímica e Físico-Química) capazes de atender satisfatoriamente a demanda de mais um curso na área da tecnologia. Paralelo é importante salientar que o curso de Engenharia de Produção da UEAP já contemplava laboratórios específicos de Materiais e Fenômenos de Transporte, que efetivamente são usados para a formação dos novos e futuros profissionais, os engenheiros químicos formados na UEAP.

A principal finalidade do curso de Engenheira Química da UEAP é formar profissionais capacitados para atuar em projeto, operação, controle, investigação de falhas e gerência em indústrias de processos químicos e/ou físicos, trabalhando em uma grande variedade de atividades industriais, tais como: Biotecnologia, Drogas e Produtos Farmacêuticos com produtos de origem natural e sintética, Graxas e Gorduras, Fertilizantes e Produtos Químicos, inclusive de origem natural, Tintas Vernizes e Pigmentos, Polímeros, Pesticidas e Herbicidas, Materiais Plásticos e Resinas Sintéticas, Alimentos e Bebidas, Produtos Metálicos, podendo também atuar na gestão política, devido aos aspectos ambientais e econômicos.