O curso oferece diversas linhas de pesquisa que refletem a complexidade e a riqueza da Amazônia. Entre as principais áreas de investigação, destacam-se o Manejo Florestal, que inclui estudos sobre o crescimento, produção e inventário de florestas tropicais, modelagem florestal e aprendizado de máquinas aplicado à mensuração florestal; Meio Ambiente e Conservação da Natureza, com foco na recuperação de áreas degradadas, manejo de fauna e bacias hidrográficas; Silvicultura, que envolve o estudo de solos florestais, cultivo de espécies florestais nativas e exóticas, proteção florestal e dendrologia; e a Tecnologia e Utilização de Produtos Florestais, que abrange pesquisas sobre propriedades físicas e mecânicas da madeira, utilização de produtos florestais madeireiros e não madeireiros, e biotecnologia florestal. Essas linhas de pesquisa são integradas ao ensino e à extensão, promovendo uma formação robusta para enfrentar os desafios ambientais e socioeconômicos da região amazônica. Atualmente, o curso conta com três grupos de pesquisa:

Tecnologia de Produtos Lignocelulósicos e Bioenergia: http://dgp.cnpq.br/dgp/espelhogrupo/4013811198145174

Métodos Quantitativos Aplicados aos Recursos Florestais: https://dgp.cnpq.br/dgp/espelhogrupo/470597

Ecologia do fogo e sensoriamento remoto (EFSR): http://dgp.cnpq.br/dgp/espelhogrupo/5674105088105365